Ну не может моя сестрёнка быть такой милой

17-летний Кёсукэ Косака не общался со своей 14-летней сестрой уже несколько лет. Как так получилось — он и сам не знает, просто с какого-то момента Кирино [高坂 桐乃] начала провожать его подозрительными взглядами, полностью игнорируя все попытки завести разговор. Похоже, отношения испортились навсегда.

Однажды Кёсукэ находит в доме DVD с махо-сёдзё на обложке. Чьё бы это могло быть? Родители таким не увлекаются, а уж работающая моделью сестра — тем более. Что ещё более странно, под обложкой диска оказывается совершенно другая игра — эроге «Imouto to Koishiyo!» (рус. «Любовь с младшей сестрёнкой»). В попытке осторожно выяснить всё за обедом Кёсукэ терпит полную неудачу, получив отрицательный ответ ото всех, и в особенности от работающего в полиции отца, убеждённого антиотаку.

Той же ночью Кёсукэ просыпается от пощёчины сестры, которая заявляет, что им надо поговорить, и зовёт в свою комнату. Тут-то и выясняется, что диск принадлежит Кирино, а сама она — тайная отаку, обожающая махо-сёдзё и хентайные игры. А особый интерес у неё к играм про любовь между братом и сестрой...